在合肥注册一家专利代办公司，需要提交的材料主要包括：

设立专利代理机构申请表：这是申请设立专利代办公司的基本表格，需要详细填写相关信息。

专利代理机构的合伙协议书或者章程：如果是合伙企业，需要提交合伙协议书;如果是公司制企业，则需要提交公司章程。这些文件应明确企业的经营范围、股东权益、组织机构等重要事项。

验资证明：需要提供验资机构出具的验资报告，以证明企业的注册资本已经实缴。

专利代理人资格证和身份证的复印件：专利代办公司必须拥有一定数量的具备专利代理人资格的员工，因此需要提交这些员工的资格证和身份证复印件。

人员简历及人事档案存放证明和离退休证件复印件：这些材料用于证明专利代办公司员工的资历和经验，以及他们的人事关系情况。

办公场所和工作设施的证明：需要提供企业办公场所的租赁合同或产权证明，以及工作设施的相关证明，以证明企业具备正常的办公条件和工作环境。

其他必要的证明材料：可能包括企业法人的身份证明、企业的银行账户证明等，这些材料根据当地工商行政管理部门的具体要求而定。

此外，根据《公司法》的相关规定，还需要提交一些通用的公司注册材料，如：

公司法定代表人签署的《公司设立登记申请书》：用于申请公司的设立登记。

全体股东签署的公司章程：明确公司的经营范围、股东权益、组织机构等重要事项。

法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件：用于证明股东的身份和资格。

指定代表或委托代理人证明：如果是委托他人代为办理公司注册手续，需要提交这份证明。

代理人身份证及其复印件：代理人的身份证明文件。

住所使用证明：需要提供企业住所的租赁合同或产权证明，以证明企业有合法的住所。

以上材料仅供参考，具体所需材料可能因地区、政策等因素而有所不同。建议在注册前详细咨询当地工商行政管理部门或专业服务机构，以确保准备齐全、正确的材料。