在合肥，公司补交税款和滞纳金可以选择以下几种方式：

一、网上申报缴纳

登录电子税务局：公司可以通过访问国家税务总局安徽省电子税务局网站(https://etax.anhui.chinatax.gov.cn)进行登录。

选择申报缴纳：在电子税务局系统中，选择相应的税种和申报期，填写申报表并提交。

缴纳税款和滞纳金：根据系统提示，选择网上支付方式(如银行转账、第三方支付等)完成税款和滞纳金的缴纳。

二、银行转账缴纳

获取缴款信息：公司需先向税务机关获取具体的缴款信息，包括缴款账号、缴款金额等。

银行转账：按照获取的缴款信息，通过公司银行账户进行转账操作。

确认缴纳：转账完成后，需向税务机关确认税款和滞纳金是否已成功缴纳。

三、办税服务厅现场缴纳

准备材料：携带公司的税务登记证、财务报表、税务申报表等相关材料。

前往办税服务厅：前往合肥市税务局第二税务分局办税服务厅(地址：合肥市滨湖区万泉河路与峨眉山路交口南50米)或其他指定的办税服务厅。

办理缴纳手续：在办税服务厅窗口，向工作人员说明补交税款和滞纳金的情况，并提交相关材料。工作人员会协助办理缴纳手续。

注意事项

及时缴纳：逾期未交税会产生滞纳金，因此公司应尽快补交税款和滞纳金，以减少经济损失。

保留凭证：缴纳完成后，务必妥善保存缴税凭证，如银行转账回单、税收完税证明等，以备后续查询和审计。

咨询税务机关：如有任何疑问或不确定的地方，建议及时咨询当地税务机关，以获取准确的指导和帮助。